怀孕期间协议离婚，关于孩子抚养权的归属可以由夫妻双方协商确定。
如果双方协商一致，可在离婚协议中明确孩子出生后的抚养权归某一方，同时可以约定抚养费的数额、支付方式以及探视权等相关事宜。
一般情况下，在确定抚养权归属时，法院会考虑以下因素：孩子的年龄、性别、健康状况、成长环境、父母的抚养能力和抚养条件等。如果孩子尚未出生，很难准确判断具体抚养权的归属，但双方可以根据各自的意愿和实际情况进行协商约定。
需要注意的是，怀孕期间女方可以提出离婚，男方一般不得提出离婚，除非人民法院认为确有必要受理男方离婚请求。